À travers les Comores, la lutte contre le choléra reste intense, avec plus de 10 000 cas enregistrés depuis le début de l’épidémie, concentrés principalement sur Anjouan. À la fin de juin, le bilan faisait état de 10 142 cas, dont 55 hospitalisations, 9 940 guérisons et 147 décès. La propagation continue sur Anjouan avec 28 nouveaux cas signalés le 30 juin, contre un seul à Grande Comore et deux à Mohéli.
En réponse, le gouvernement a lancé une campagne de vaccination à l’échelle nationale, atteignant près de 50 % de l’objectif avec 407 841 personnes vaccinées. Anjouan montre un taux de vaccination élevé de 72 %, soit 273 541 personnes, crucial étant donné la gravité de la situation sur cette île. Mohéli a vu 29 280 personnes vaccinées, représentant 47 % de sa population, tandis que Grande Comore a atteint seulement 24 % avec 105 020 personnes vaccinées.
Initialement, les autorités ont dû surmonter la défiance de la population concernant la réalité du choléra. La vaccination devrait significativement réduire la propagation de la maladie et atténuer son impact sur les Comores, contrairement à Mayotte où la situation reste moins grave.